SMP Negeri 3 Batam mengadakan beberapa pilihan ekstrakurikuler, sesuai minat dan bakat peserta didik.
Berikut daftar ekstrakurikuler yang dapat diikuti.
 ROHIS | Olimpiade Sains |  Math Club |
Futsal | Karate | Pencak Silat |
| | |
| | |
SMP Negeri 3 Batam mengadakan beberapa pilihan ekstrakurikuler, sesuai minat dan bakat peserta didik.
Berikut daftar ekstrakurikuler yang dapat diikuti.
ROHIS | Olimpiade Sains | Math Club |
Futsal | Karate | Pencak Silat |
| | |
| | |